Алтайская краевая универсальная научная библиотека им. В.Я. Шишкова является сокровищницей культурного и исторического наследия Алтая. Обладая крупнейшим книжным фондом в регионе, она является также основным фондодержателем книжных памятников. Сегодня в библиотеке более 46 тысяч экземпляров книжных памятников: рукописные и печатные книги XVI-XXI, периодические издания XVIII- нач. XIX вв., открытки, фотографии, карты. Книжные памятники со времени основания библиотеки не были объектом собирательства, они составляли ее живой фонд, использовались читателями библиотеки, служили просвещению населения г. Барнаула.

Созданная по инициативе Общества попечения о начальном образовании (ОПОНО) и при поддержке Барнаульской городской думы в феврале 1888 г., как Общественная городская библиотека, она в XX в. стала главной библиотекой Алтая.

Собирался фонд библиотеки, разумеется, не вдруг, этапы его формирования - это страницы истории становления библиотеки. На момент открытия библиотеки в ней было чуть более 2 тысяч экземпляров книг. Интересен тот факт, что в основу первоначальных фондов библиотеки легло личное книжное собрание В.К. Штильке, а также небольшое книжное собрание Барнаульской городской думы. Участие в пополнении фонда библиотеки приняли и многие горожане. Они передавали книги из своих личных библиотек: кто 1, а кто 40 и более экземпляров. В 1914 г. в фонд библиотеки влилось книжное собрание из 400 томов семьи Пушкаревых, которое подарил библиотеке писатель Г.М. Пушкарев.

К сожалению, все эти книжные собрания погибли вместе со всем фондом библиотеки в пожаре 1917 г., когда по неосторожности в обращении с огнем одного из жителей, сгорела почти половина города.

Возрожденная из пепла библиотека наращивала свои фонды различными путями, один из которых - включение в свои фонды книжных собраний закрывающихся библиотек.

Книжные собрания барнаульских дореволюционных библиотек (учебных, ведомственных и общественных) определяют сегодня состав фонда отдела редких книг. Книжные знаки в виде штемпелей, экслибрисов, суперэкслибрисов, а также различного рода инскриптов, очень ярко и живописно рассказывают нам сегодня о тех библиотеках, что имелись в Барнауле в XIX - XX вв.

Организация фонда редких книг по коллекциям началось с первого года (1980) существования в библиотеке специализированного структурного подразделения по работе с редкими книгами. Сначала это был Кабинет редких книг, позднее сектор, а с 1994 г. - отдел. Работа с книжными коллекция сегодня предусматривает пополнение уже имеющихся и создание новых. Ведется научно-исследовательская работа с коллекциями, составляются их описания.

Основу фонда редких книг составили книжные собрания Барнаульской городской общественной библиотеки, библиотеки Барнаульского реального училища Николая II, библиотек Общества попечения о начальном образовании г. Барнаула, Союза Кооперативов, многие личные библиотеки, а также многих других библиотек города, хранившиеся в АКУНБ.